Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf15Q5UBV8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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