Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brip1Q5SXJ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms