Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sun3Q5SS91 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sun3Q5SS91 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sun3Q5SS91 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sun3Q5SS91 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sun3Q5SS91 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sun3Q5SS91 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms