Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps54Q5SPW0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms