Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brsk1Q5RJI5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms