Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp28Q5I043 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp28Q5I043 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp28Q5I043 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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