Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam208bQ5DTT3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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