Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms