Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syne3Q4FZC9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Syne3Q4FZC9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syne3Q4FZC9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Syne3Q4FZC9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syne3Q4FZC9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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