Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt35Q497I4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt35Q497I4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms