Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa20Q45VN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa20Q45VN2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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