Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6430531B16RikQ3V2J1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms