Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rimbp3Q3V0F0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rimbp3Q3V0F0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rimbp3Q3V0F0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms