Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms