Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhdc9Q3USL1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms