Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms