Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Skap2Q3UND0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms