Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfod1Q3UHD2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms