Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms