Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rrp36Q3UFY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rrp36Q3UFY0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms