Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U4G0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U4G0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms