Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc174Q3U155 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc174Q3U155 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms