Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pnpla6Q3TRM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms