Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cwc27Q3TKY6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cwc27Q3TKY6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms