Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pde12Q3TIU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde12Q3TIU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms