Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem248Q3TBN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms