Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim71Q1PSW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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