Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Spatc1Q148B6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Spatc1Q148B6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spatc1Q148B6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spatc1Q148B6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spatc1Q148B6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms