Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms