Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms