Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnma1Q08460 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms