Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata4Q08369 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms