Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Calb2Q08331 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms