Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou6f1Q07916 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms