Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcn1Q05186 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcn1Q05186 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms