Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdk16Q04735 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms