Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crisp3Q03402 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crisp3Q03402 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms