Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms