Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp11Q02853 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp11Q02853 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms