Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb4Q02738 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms