Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GscQ02591 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GscQ02591 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GscQ02591 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GscQ02591 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GscQ02591 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GscQ02591 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GscQ02591 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GscQ02591 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GscQ02591 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GscQ02591 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GscQ02591 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms