Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlh1Q02576 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms