Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 DDI3YNL335W 678 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 YPL107WYPL107W 747 nt2.84□□□□□ -1.95
NUP49Q02199 ATG13YPR185W 2217 nt2.84□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ATP25YMR098C 1839 nt2.84□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ERG11YHR007C 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MDV1YJL112W 2145 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ITC1YGL133W 3795 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 OPI6YDL096C 327 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 PCD1YLR151C 1023 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YLR297WYLR297W 390 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TIF34YMR146C 1044 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 CLD1YGR110W 1338 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SRC1YML034W 2505 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 PRP8YHR165C 7242 nt2.83□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR237CYGR237C 2358 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MOT1YPL082C 5604 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 NDC80YIL144W 2076 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SDP1YIL113W 630 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 AIM25YJR100C 984 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TTI2YJR136C 1266 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SDH3YKL141W 597 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TIS11YLR136C 858 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ERG2YMR202W 669 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TAF3YPL011C 1062 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YBR089WYBR089W 600 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SHE3YBR130C 1278 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 NMD2YHR077C 3270 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 CEP3YMR168C 1827 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RPC11YDR045C 333 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR442WYDR442W 393 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TOS8YGL096W 831 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SDT1YGL224C 843 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MCM16YPR046W 546 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MTH1YDR277C 1302 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 GAT2YMR136W 1683 nt2.81□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 UBP5YER144C 2418 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RKM4YDR257C 1485 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 DYN2YDR424C 279 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ARD1YHR013C 717 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YKL091CYKL091C 933 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ARO7YPR060C 771 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YBR242WYBR242W 717 nt2.8□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 VBA4YDR119W 2307 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MEF1YLR069C 2286 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YER137C-AYER137C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YER159C-AYER159C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YJR026WYJR026W 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YJR028WYJR028W 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YAR010CYAR010C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YML040WYML040W 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YML045W-AYML045W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YMR051CYMR051C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 GRX6YDL010W 696 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RPS29BYDL061C 171 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MIX14YDR031W 366 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 PAN5YHR063C 1140 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 AGE2YIL044C 897 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RLP7YNL002C 969 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TUM1YOR251C 915 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RPA43YOR340C 981 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YAT2YER024W 2772 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SEC7YDR170C 6030 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 STE6YKL209C 3873 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ESL1YIL151C 3357 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RMD1YDL001W 1293 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YGR273CYGR273C 525 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 PET130YJL023C 1044 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 PPA2YMR267W 933 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 SSN8YNL025C 972 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 RAS1YOR101W 930 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YPR150WYPR150W 522 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 YBR300CYBR300C 498 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 MSM1YGR171C 1728 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 TGL1YKL140W 1647 nt2.78□□□□□ -1.96
NUP49Q02199 ALG8YOR067C 1734 nt2.77□□□□□ -1.97
NUP49Q02199 DYN1YKR054C 12279 nt2.77□□□□□ -1.97
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