Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkcqQ02111 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms