Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms