Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp1Q02013 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aqp1Q02013 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms