Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mc1rQ01727 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mc1rQ01727 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms