Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms