Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VldlrP98156 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms