Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shc1P98083 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shc1P98083 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shc1P98083 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms